У кишечнику людини знайшли майже дві тисячі невідомих бактерій

Вчені виявили в кишковій мікрофлорі 1952 невідомих раніше видів бактерій, повідомляється в Nature. Більше чверті з них відноситься до невідомих колекцій, а 40 відсотків — до невідомих пологах. Судячи з послідовності генома, деякі з них виробляють антимікробні речовини або речовини, потенційно застосовні в біотехнології.

В останні роки з'явилося чимало досліджень, які показували, що кишковий мікробіом впливає на імунну систему, регулює роботу мозку, впливає на психологію і поведінку. Вчені пов'язали «неправильний» склад кишкової мікрофлори з виникненням гіпертонії та інсульту, а також з затримкою росту дітей. Однак склад кишкового мікробіома досі вивчений не надто добре.

Британські, австралійські та канадські дослідники під керівництвом Роберта Флінна (Robert D. Finn) з Європейського інституту біоінформатики реконструювали понад 92 тисяч геномів організмів із зразків кишкового мікробіома 11850 людина. В основному це були жителі Європи або Північної Америки. Автори досліджували зразки з допомогою метагеномного аналізу, який дозволяє вивчати мікробні спільноти, що живуть у різних середовищах або організмах, не виділяючи окремі види бактерій, вірусів і грибків.

Вчені прослідковували зразки кишкової мікрофлори, збирали бактеріальні геноми і порівнювали їх з відомими послідовностями, які вже були у базі даних Національного інституту здоров'я. Таким чином вони знайшли вже відомі види бактерій і виключили їх з подальшого аналізу. З решти 11,9 тисяч геномів вони вибрали ті, послідовності яких були зібрані більш ніж наполовину. Крім того, вчені перевірили вибрані геноми на можливу відповідність вже відомим таксонам бактерій. Вони порівняли можливі послідовності бактеріальних білків з референтними, з бази даних (знаючи послідовність ДНК в тому чи іншому гені, можна визначити і послідовність білка, який він кодує). Всього автори відібрали 1952 геному.

Дослідники змогли віднести понад 90 відсотків геномів до певного типу, класу і загону бактерій. Але більше чверті геномів (26 відсотків) ставилися до невідомих колекцій, а 40 відсотків — до невідомих пологах. Ті бактерії, які вдалося класифікувати, найчастіше входили в родину кориобактерий (Coriobacteriaceae, 20,6 відсотків), або належали до роду колинзелл (17,7 відсотків) і клостридій (7,3 відсотка). Також автори знайшли в послідовностях бактеріальних ДНК гени, пов'язані з синтезом бактеріоцинів (білків, що пригнічують діяльність бактерій того же або споріднених видів) і нерибосомальных пептидів. Можливо, бактерії у складі кишкової мікрофлори виробляють антибактеріальні речовини або речовини, потенційно застосовні в біотехнології.

Вчені не тільки вивчають кишковий мікробіом людини, але і знаходять йому незвичайне застосування. Так, нещодавно дослідники запропонували робити з кишкового мікробіома марафонців харчові добавки, або пізнавати по микробиомному відбитком залезающих в будинку злодіїв.

Нагадаємо, раніше повідомлялося, що в мозку людини знайшли невідомий раніше мікробіом.

Хочете знати важливі та актуальні новини раніше за всіх? Підписуйтесь на сторінку Bigmir)net на Facebook: facebook.com/bigmir.net.

Категория: Технологии