У США створюють генетичний Ноїв ковчег

Опубликованно 03.10.2018 05:08

Учасники консорціуму Genome 10K на щорічній конференції, яка проходить зараз в Нью-Йорку, оголосили про запуск міжнародного проекту «Геноми хребетних», його завдання - зібрати геноми всіх 66 тисяч видів хребетних, які живуть на сьогоднішній день на планеті. Детальніше про цілі та завдання проекту розповідає Gizmodo.

У 2009 році американські біологи Девід Хасслер (David Haussler), Олівер Райдер (Oliver Ryder) та Стівен о'брайен (Stephen o'brien) заснували проект Genome 10К, метою якого було отсеквенировать 10 тисяч геномів хребетних. На початковому етапі в проекті брало участь 55 вчених з великих зоопарків, дослідницьких центрів та музеїв. Спочатку було незрозуміло, скільки часу займе зібрати геноми достатньої якості. Але зі здешевленням і спрощенням методів секвенування стало зрозуміло, що проект виконає свої завдання через кілька років. Останні три роки учасники проекту порівнювали основні технології секвенування ДНК і аналізу отриманих результатів, з тим, щоб вибрати ту з них, яка дозволить створити «платинові геноми».

Вчора учасники Genome 10K оголосили про запуск нового проекту «Геноми хребетних», метою якого буде зібрати геноми чоловічої і жіночої особини 66 тисяч видів хребетних тварин. У проекті будуть брати участь 150 учених, що представляють 50 організацій з 12 країн. За словами одного з творців проекту Олівера Райдера, в результаті біологи зможуть зрозуміти причини вимирання видів, у тому числі траплялися в історії виду близькоспоріднені схрещування, «пляшкові горлечка», в результаті яких зменшувалася генетичну різноманітність виду або делеції — мутації, який можуть «вимкнути» необхідні для виживання організму гени.

Разом з оголошенням про новому проекті вчені відразу представили перші результати його роботи: геноми 15 видів хребетних, в тому числі зникаючого совиного папугу какапо, ендеміка Нової Зеландії, і австралійського качкодзьоба. Ці та всі інші геноми, які планують зібрати дослідники, будуть опубліковані у відкритому доступі, бази даних «Геномний Ноїв ковчег».

Учасники планують секвенувати короткі ділянки геномної ДНК і збирати з них все довші послідовності аж до цілої хромосоми, а потім «склеювати» їх за допомогою алгоритмів, розроблених спеціально для проекту.

Раніше дослідники змогли прочитати геном людини на кишеньковому секвенаторе розміром зі смартфон. Прилад поставив рекорд по найдовшому прочитання молекули ДНК, він виявився здатний секвенувати послідовності довжиною до 882 тисячі пар підстав.

Нагадаємо, раніше з'ясувалося, що майже 92% ДНК людини не мають ніякої цінності.

Категория: Технологии